Karierę rozpoczął w Karwinie, a konkretnie w klubie MFK Karwina, dla którego rozegrał osiemdziesiąt meczów w ciągu czterech sezonów, w których udało mu się strzelić dwanaście goli. W 2020 roku został kupiony przez praską Slavię.

Swój pierwszy mecz w koszulce Slavii rozegrał przeciwko Dynamo Czeskie Budziejowice, który Slavia wygrała 6:0, a Lingr wszedł jako rezerwowy. Na premierowe trafienie w nowych barwach czekał do 6 grudnia i derbów ze Spartą. W sezonie 2021/2022 Lingr strzelił łącznie 14 bramek, zajmując czwarte miejsce w tabeli strzelców.

Ondřej Lingr grał też dla reprezentacji Czech w drużynach młodzieżowych U16, U17, U18, U19, U20 i U21. W dorosłej kadrze zadebiutował w meczu kwalifikacyjnym do Mistrzostw Świata FIFA ze Szwecją 22 marca 2022 roku, który reprezentacja Czech przegrała 0:1. Wszedł wtedy z ławki.

21 sierpnia w czeskich mediach pojawiła się informacja, że ofertę za niego złożył Feyenoord. Kluby szybko się porozumiały, a Czech niedługo potem podpisał kontrakt. 

DEBIUT W FEYENOORDZIE: 03-09-2023 FC Utrecht - Feyenoord 1-5